THÔNG TIN TÓM TẮT VỀ NHỮNG KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN TIẾN SĨ
Tên đề tài: KHAI THÁC DỮ LIỆU DNA ĐA HỆ GEN, BIỂU HIỆN VÀ NGHIÊN CỨU TÍNH CHẤT CỦA β-XYLOSIDASE TỪ VI SINH VẬT RUỘT MỐI Coptotermes gestroi Ở VIỆT NAM
Chuyên ngành: Di truyền học
Mã số: 62. 42. 01. 21
Nghiên cứu sinh: Nguyễn Minh Giang
Cán bộ hướng dẫn: GS.TS.Trương Nam Hải và PGS.TS. Đặng Hữu Lanh
Cơ sở đào tạo: Trường Đại học Sư phạm Hà Nội
Những kết luận mới của luận án
1. Nghiên cứu đã khai thác được 20 loài vi khuẩn có số lượng ORF lớn phù hợp với chế độ ăn gỗ giàu lignocellulose và nghèo Nitơ của mối C. gestroi từ dữ liệu trình tự DNA đa hệ gen. Trong đó có 03 loài tham gia chuyển hóa Nitơ và 05 loài tham gia thủy phân lignocellulose không có ở các loài mối khác. Đồng thời xác định các lignocellulase của vi sinh vật ruột mối C. gestroi thuộc về 52 họ GH khác nhau theo phân loại của CAZY.
2. Xây dựng được phương pháp tìm kiếm gen từ dữ liệu trình tự DNA đa hệ gen bằng mẫu dò dựa vào các trình tự axit amin đã nghiên cứu tính chất và sự hỗ trợ của các công cụ tin sinh học, theo định hướng ứng dụng về khả năng chịu nhiệt và chịu kiềm của enzyme. Sử dụng mẫu dò thuộc họ GH43 có độ dài là 464 axit amin đã tìm kiếm được gen GL0112518 mã hóa β–xylosidase từ dữ liệu DNA đa hệ gen của vi khuẩn ruột mối C. gestroi;
3. Biểu hiện thành công gen Xbx14 có hoạt tính β–xylosidase đúng như dự đoán ban đầu, với các thông số động học theo phương trình Lineweaver-Burk là Km = 3,18 mM, Vmax = 6,5 mol/phút và hoạt tính riêng đạt được là 24,54 U/mg. Đây là một enzyme mới, có hoạt tính tốt với khả năng hoạt động tối ưu trong điều kiện nhiệt độ cao và pH kiềm.
