THÔNG TIN TÓM TẮT VỀ NHỮNG KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN TIẾN SỸ
– Tên đề tài: “Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm A/H5N1 đương nhiễm tại Việt Nam”.
– Mã số: 62 72 01 12
– Chuyên ngành: Hóa sinh Y học.
– Nghiên cứu sinh: Nguyễn Mạnh Kiên
– Người hướng dẫn:
1. PGS.TS. Lê Thanh Hòa – Viện Công nghệ sinh học – Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam.
2. PGS.TS. Đặng Thị Ngọc Dung – Trường Đại học Y Hà Nội.
– Cơ sở đào tạo: Trường Đại học Y Hà Nội.
– Tóm tắt những kết luận mới của luận án:
1– Sáu biến chủng virus cúm A/H5N1 phân lập tại Việt Nam từ 2007 – 2011 trong nghiên cứu, chứa các gen PB2, PB1 và PA không có đột biến về số lượng nucleotide và amino acid mã hóa, so với các gen tương ứng của virus A/H5N1 phân lập từ 2003 đến nay.
– Protein PB2 của 6 biến chủng virus này có sự bảo tồn glutamic acid tại vị trí 627 (E627) và aspartic acid tại vị trí 701 (D701). Protein PB1-F2 của chủng A/Duck/VietNam/QT801/2011(H5N1) clade 2.3.2.1 chỉ chứa 9 amino acid. Protein PB1-F2 của chủng A/Duck/VietNam/QT802/2011(H5N1) clade 2.3.2.1 và 2 chủng: A/Chicken/VietNam/DT382/2008(H5N1), A/Duck/VietNam/TG926/2009(H5N1) clade 1.1, có đột biến thay đổi amino acid từ arginin thành serin tại vị trí 66 (N66S).
– Phức hợp enzym polymerase của 6 biến chủng virus cúm A/H5N1 nghiên cứu, có sự thay đổi 12 amino acid gồm: 4 vị trí (I504V, Q508R, I675L và A683T) trong protein PB2, 4 vị trí (L13P, V171M, R198K và H436Y) trong protein PB1, 4 vị trí (P224S, S515T, I550L và N615K) trong protein PA, tương tự nhóm virus cúm A/H5N1 độc lực cao được biết cho đến nay.
2– Các gen PB2, PB1 và PA polymerase của 6 biến chủng virus nghiên cứu, gồm: A/Duck/VietNam/QT801/2011(H5N1) và A/Duck/VietNam/QT802/2011(H5N1) (clade 2.3.2.1), A/Duck/VietNam/NA72/2007(H5N1) và A/Duck/VietNam/NA114/202007(H5N1) (clade 2.3.4.3), A/Chicken/VietNam/DT382/2008(H5N1) và A/Duck/VietNam/TG926/2009(H5N1) (clade 1.1), lần lượt theo thứ tự đều đạt tỉ lệ tương đồng 96% – 99% về nucleotide và 98% – 99% về amino acid, so với các gen tương ứng của virus A/H5N1 clade 2.3.2.1, 2.3.4.3 và 1.1 phân lập từ 2007 đến nay.
3– Các gen PB2, PB1 và PA của 2 biến chủng virus: A/Duck/VietNam/QT801/2011(H5N1) và A/Duck/VietNam/QT802/2011(H5N1) (clade 2.3.2.1), cùng với 2 biến chủng A/Duck/VietNam/NA72/2007(H5N1) và A/Duck/VietNam/NA114/202007(H5N1) (clade 2.3.4.3), có nguồn gốc từ nguồn gen virus A/H5N1 genotype V hình thành tại Trung Quốc giai đoạn 2004 – 2006. Các gen trên của 2 biến chủng A/Chicken/VietNam/DT382/2008(H5N1) và A/Duck/VietNam/TG926/2009(H5N1) (clade 1.1), có nguồn gốc từ nguồn gen virus A/H5N1 genotype Z hình thành tại Trung Quốc giai đoạn 2002 – 2003.
